Bagi jamaah haji atau umrah asal Indonesia atau pengunjung lainnya yang berkesempatan ke sana, biasanya akan melaksanakan sholat dua rakaat dan menikmati keindahan bangunan yang penuh sejarah itu.
Hal ini dikarenakan masjid ini memiliki keutamaan bagi orang yang sholat di dalamnya. Di antaranya sholat di dalamnya bernilai seperti pahala umrah. Hal ini sesuai sesuai dengan sabda Rasulullah Shallallahu 'alaihi wa sallam bersabda:
"Barang siapa yang keluar dari rumahnya kemudian mendatangi masjid ini, yakni Masjid Quba, kemudian sholat di dalamnya, maka pahalanya seperti ia menjalankan umrah." (Ibnu Majah)
Masjid ini juga menjadi awal sejarah sholat berjamaah. Rasulullah Shallallahu 'alaihi wa sallam bersama para sahabat melakukan sholat berjamaah untuk pertama kalinya di Masjid Quba.