Menamatkan pendidikan dasar di Padang, dua gelar S1 diperoleh di Fakultas Usluhuddin Universitas Ibnu Riyadh (1983) dan Fakultas Tarbuyah IAIN Imam Bonjol 1984. Kemudian S2 dan S3 diselesaikan di IAIN Sunan Kalijaga pada 1996 dan 2004.
Selama di Muhammadiyah, Yunahar pernah menjabat sebagai Ketua Majelis Tabligh dan Dakwah Khusus PP Muhammadiyah periode 2000-2005. Selanjutnya pada periode 2005-2010 menjabat sebagai Ketua PP Muhammadiyah.
Di luar Muhammadiyah, ia tercatat sebagai salah satu unsur ketua di Majelis Ulama Indonesia Pusat. Sehari-hari Yunahar bekerja sebagai dosen atau Guru Besar di Fakultas Agama Islam Universitas Muhammadiyah Yogyakarta sejak 1987.
(Abu Sahma Pane)