Dari guru-gurunya beliau mendapat ijazah khas (khusus), dan juga ‘Am (umum) dalam Da’wah dan nasyru syari’ah (menyebarkan syari’ah), thariqah, tashawuf, kitab-kitab hadits, tafsir, sanad, riwayat, dirayat, nahwu, kitab-kitab tauhid, tashwuf, bacaan-bacaan aurad, hizib-hizib, kitab-kitab shalawat, kitab thariqah, sanad-sanadnya, nasab, kitab-kitab kedokteran. Dan ia juga mendapat ijazah untuk membai’at.
Selanjutnya, pada usia masih remaja Habib Luthfi dinikahkan dengan seorang gadis yang masih tergolong kerabat yakni Syarifah Salma binti Hasyim bin Yahya.
Dari pernikahan itu lahir dua orang anak laki-laki dan tiga perempuan yaitu Syarif Muhammad Bahauddin, Syarifah Zaenab, Syarifah Fathimah, Syarifah Ummi Hanik dan Syarif Husain.