Sebelum meninggal, Suprapto dan sang istri Soejantini menginap di Hotel Abraj Taba, Madinah sempat melaksanakan sholat, lalu ke kamar mandi. Saat di kamar mandi, Suprapto sempat meminta pertolongan.
Almarhum selanjutnya dibaringkan di dalam kamar. Namun tidak lama kemudian mengembuskan nafas terakhirnya. Soejantini, istri almarhum ikhlas memakamkan suaminya di Makam Baqi, Madinah.
(Dani Jumadil Akhir)